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parution suspendue
An international journal of food science and technology
 

 ARTICLE VOL 22/1-2 - 2002  - pp.151-160  - doi:10.3166/sda.22.151-160
TITRE
Organisation des gènes codant la glycérol déshydratase de Lactobacillus collinoides, Lactobacillus hilgardii et Lactobacillus diolivorans

TITLE
Organisation of the genes encoding glycerol dehydratase of Lactobacillus collinoides, Lactobacillus hilgardii and Lactobacillus diolivorans

RÉSUMÉ

Les souches Lactobacillus collinoides IŒB 9527, Lactobacillus hilgardii IŒB 0003, et la souche IŒB 0004 appartenant à l'espèce récemment décrite Lactobacillus diolivorans qui dégradent le glycérol en anaérobiose ont été étudiées. Deux amorces nucléotidiques dégénérées, déduites des alignements de séquence de gènes codant la glycérol déshydratase de Citrobacter freundii, Klebsiella pneumoniae, Klebsiella oxytoca, Salmonella typhimurium et Clostridium pasteurianum ont été utilisées pour des amplifications par PCR. Les trois amplifiats de 279 pb de L. collinoides, L. hilgardii et L. diolivorans montrent de fortes homologies avec les parties de gènes de glycérol déshydratases déjà séquencés. Les trois amplifiats ont été utilisés pour dessiner des amorces spécifiques pour des réactions de "PCR-inverse" de façon à étudier les gènes entiers des trois espèces. Les fragments amplifiés ont été clonés et séquencés et plusieurs cadres ouverts de lecture ont été identifiés. Pour les trois espèces, l'organisation des gènes codant les enzymes de la dégradation du glycérol suggère l'arrangement en opérons. Des protéines déduites de certains ORF sont très semblables aux protéines de la famille des carboxysomes. Les autres sont similaires aux trois sous-unités glycérol ou propanediol déshydratase dépendantes d'adénosylcobalamine de C. freundii, K. pneumoniae, K. oxytoca et S. typhimurium.

ABSTRACT

Lactobacillus collinoides IŒB 9527, Lactobacillus hilgardii IŒB 0003 and strain IŒB 0004 belonging to the recently described Lactobacillus diolivorans species which could degrade glycerol in anaerobic conditions were studied. Two degenerated primers, deduced from Citrobacter freundii, Klebsiella pneumoniae, Klebsiella oxytoca, Salmonella typhimurium and Clostridium pasteurianum glycerol dehydratase sequence alignments, were used for polymerase chain reaction amplification. The three 279 base pair amplicons from L. collinoides, L.hilgardii and L. diolivorans showed high homologies with part of the glycerol dehydratase genes already sequenced. The three amplicon DNA nucleotide sequences were used to design specific primers for inverse-PCR in order to study the entire glycerol dehydratase genes of the three species. Amplified fragments were cloned and then sequenced, several open reading frames were identified. For the three species, the genetic organization of the glycerol degradation genes suggested operons. Some deduced proteins were very similar to the carbon dioxide concentrating protein family. The others are three subunits similar to adenosylcobalamin dependent glycerol or propanediol dehydratases respectively from C. freundii, K. pneumoniae and K. oxytoca and S. typhimurium.

AUTEUR(S)
Andrea GORGA, Olivier CLAISSE, Aline LONVAUD-FUNEL

MOTS-CLÉS
glycérol déshydratase, opéron.

KEYWORDS
glycerol dehydratase, lactic acid bacteria, operon.

LANGUE DE L'ARTICLE
Anglais

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