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parution suspendue
An international journal of food science and technology
 

 ARTICLE VOL 22/1-2 - 2002  - pp.55-58  - doi:10.3166/sda.22.55-58
TITRE
Analyse du génome de Lactobacillus sakei 23K et son implication sur l'étude biologique et génétique de l'espèce.

TITLE
Genome analysis of Lactobacillus sakei 23K: toward new biological and genetic studies of the species

RÉSUMÉ

La physiologie de Lactobacillus sakei est encore peu connue si l?on compare la connaissance de cette espèce avec celle accumulée sur les bactéries lactiques de l'industrie laitière. Il existe notamment une grande variabilité phénotypique des souches de ce lactobacille. Cette variabilité serait exploitable pour mesurer l'implication réelle de L. sakei dans les différents processus qui régissent la fermentation des produits carnés. Toutefois, cette démarche nécessite l'acquisition d'outils génomiques performants. Le génome de notre souche modèle 23K est de 1,85 Mb. Une analyse cartographique a permis d'identifier avec précision la répétition d'éléments structuraux tels que opérons rrn et de l'IS1163. L'étude de ces régions et de leurs régions adjacentes seront un outils idéal pour l'étude génomique de l'espèce et la caractérisation des phénomènes de réarrangement, de délétions qui peuvent être à l'origine de la variabilité phénotypique. Finalement, un projet de séquençage du génome de la souche 23K a débuté en 2000. Un bilan actuel du projet sera présenté.

ABSTRACT

Knowledge of Lactobacillus sakei physiology is scarce. While a wealth of information is becoming available for dairy lactic acid bacteria, we are just beginning to learn about this Lactobacillus involved in meat preservation and fermentation. It is known that L. sakei displays a strong phenotypic variability of strains. As such, these variations could be used to investigate the role of this species in the processes of meat fermentation. Tools for genome analysis is an opportunity to correlate phenotypic variation with genetic diversity. The size of the L. sakei 23K strain circular chromosome is of 1.85 Mb. The characterisation of large recurrent chromosomal elements such as rrn operons or insertion sequence IS1163 will provide a very helpful basis for the study of gene rearrangements, deletions? These are large-scale chromosomal events which may explain the phenotypic variability within the species. At last, the sequencing project of strain 23K launched in the year 2000 and now to near completion, should make a interesting turnaround in the genetic and biological studies of the species.

AUTEUR(S)
Stéphane CHAILLOU, Anne-Marie DUDEZ, Monique ZAGOREC

MOTS-CLÉS
Lactobacillus sakei, cartographie du chromosome, opérons rrn.

KEYWORDS
Lactobacillus sakei, chromosome mapping, rrn operons.

LANGUE DE L'ARTICLE
Anglais

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