ACCUEIL

Consignes aux
auteurs et coordonnateurs
Nos règles d'éthique
Autres revues >>

Sciences des Aliments

0240-8813
parution suspendue
An international journal of food science and technology
 

 ARTICLE VOL 22/1-2 - 2002  - pp.45-53  - doi:10.3166/sda.22.45-53
TITRE
Etude du génome de la bactérie lactique Lactococcus lactis

TITLE
Studies of genomes of dairy bacteria Lactococcus lactis

RÉSUMÉ

Lactococcus lactis est la bactérie la plus commune dans les levains du fromage. On estime que les hommes consomment annuellement plus de 1 018 de ces bactéries. Deux souches, IL1403 et MG1363, isolées des sources industrielles et curée des plasmides, sont utilisées pour le clonage d?ADN, et pour étudier la génétique et la biologie moléculaire de cette bactérie. Ces souches appartiennent à deux clusters de souches de L. lactis désigné lactis et cremoris, distincts par les spectres des produits de fermentation laitiére. Pour créer une base pour des études génomiques de L. lactis, nous avons séquencé le génome entier de la souche IL1403 et exécuté un « co-linear scaffolding » du chromosome de la souche MG1363. Le « co-linear scaffolding » consiste en un séquençage aléatoire d?un nombre limité de clones et une cartographie par long range PCR des régions co-linéaires des deux génomes, dont un a été complètement séquencé. Dans les régions co-linéaires, établies par PCR, le contenu des gènes et leur ordre devraient être identiques. Le « co-lineare scaffolding » du génome de MG1363, qui partage une identité de 85 % avec celui d?Il1403, permet l'accès rapide à 50 % des gènes de cette souche.

ABSTRACT

Lactococcus lactis is the bacterium, which is most common in cheese starters.

Lactococcus lactis is the bacterium, which is most common in cheese starters. It is estimated that humans annually consume more than 1018 of these bacteria. Two strains, IL1403 and MG1363, isolated from industrial sources and cured from plasmids, are used for DNA cloning and to study genetics and molecular biology of this bacterium. These strains belong to two L. lactis strain clusters called lactis and cremoris, distinct by the spectra of dairy fermentation products. To create a basis for genomic studies of L. lactis we sequenced entire genome of the strain IL1403 and performed co-linear scaffolding of the chromosome of the strain MG1363. Co-linear scaffolding consists in random sequencing of a limited number of clones and Long Range PCR mapping of the co-linear regions of the two genomes, one of which was completely sequenced earlier. In the co-linear regions, established by PCR, gene content and order should be the same. The co-linear scaffolding of the MG1363 genome, which shares 85% identity with that of IL1403, allows easy access to 50% of the genes from this strain.

AUTEUR(S)
Alexander BOLOTIN, Stanislav Dusko EHRLICH, Alexei SOROKIN

MOTS-CLÉS
Lactococcus lactis, cartographie du génome, génomique comparative.

KEYWORDS
Lactococcus lactis, genomic mapping, comparative genomics.

LANGUE DE L'ARTICLE
Anglais

 PRIX
• Abonné (hors accès direct) : 34.95 €
• Non abonné : 34.95 €
|
|
--> Tous les articles sont dans un format PDF protégé par tatouage 
   
ACCÉDER A L'ARTICLE COMPLET  (664 Ko)



Mot de passe oublié ?

ABONNEZ-VOUS !

CONTACTS
Comité de
rédaction
Conditions
générales de vente

 English version >> 
Lavoisier